泉州海外交通史博物館沒有明顯的展廳分布，在寬落的空間上，除天庭外，大樓四側均是展區，由一區進入另一區，既有相連的主題，也有差異的內容，引領參觀者一層一層的踏進歷史不同的角度。
在宋元中國的世界認識了「刺桐城」(古泉州)的繁盛後，接着來到「多元社群萬國商」展區，同樣展出宋元時期的海洋貿易重要城市，泉州盛景的點點滴滴。但正如「標題所示」，展品以來自亞洲、非洲、歐洲的商人或傳教士，在泉州這個港城中，留下不同文字的墓碑，印證泉州如何包容來自不同地域的多元文化。
在進口處中央是一張大圓枱，以藍色燈光照射着一艘中國傳統三帆古商船和昔日的商貿碎瓷器貨品。按指示前行是圖文並茂的歷史資訊，由「社會精英」的宋代士大夫說起，介紹泉州府學宮和宋代逾十間的書院，成就了1418位進士，並贏得「海濱鄒魯」的美譽。
展品方面，除宋磁灶窰青釉水注和綠釉龜形硯滴外，在宗教僧侶展區中，展出了宋元時期，因寺院經濟強勁和積極參與社會公益活動，至今仍在泉州十分盛行，千多年來的佛教發展和留下來的宗教器物。至於外來的商人和傳教士融入泉州社區，甚至通婚和世代居留亦有表述。
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